Nature Commun | 核心轉(zhuǎn)錄因子NLP7的全基因組瞬時(shí)互作啟動(dòng)快速的氮級(jí)聯(lián)響應(yīng)
研究揭示了核心轉(zhuǎn)錄因子NLP7在擬南芥早期氮響應(yīng)過程中的全基因組瞬時(shí)互作機(jī)制，證實(shí)NLP7具有快速的瞬時(shí)結(jié)合活性，能夠迅速啟動(dòng)氮信號(hào)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的級(jí)聯(lián)反應(yīng)。
調(diào)控蛋白與基因間的動(dòng)態(tài)互作對(duì)于生物體在時(shí)空上響應(yīng)環(huán)境刺激及細(xì)胞代謝變化至關(guān)重要。然而，轉(zhuǎn)錄因子與其全基因組范圍上的瞬時(shí)互作在當(dāng)前研究中仍不完整。研究中，通過開發(fā)基于細(xì)胞水平的TARGET系統(tǒng)及時(shí)間梯度系列的ChIP-seq和DNA腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶標(biāo)記鑒定(DamID-seq)方法，研究人員成功捕獲了NLP7在早期氮響應(yīng)過程中的全基因組范圍的靶基因之間的穩(wěn)定和瞬時(shí)互作蛋白。
NLP7在氮供應(yīng)條件下數(shù)分鐘內(nèi)磷酸化進(jìn)入細(xì)胞核，在植物體內(nèi)調(diào)控的大部分基因通常通過傳統(tǒng)ChIP方法難以檢測(cè)到。這些靶基因可能通過瞬時(shí)互作的形式或受NLP7間接調(diào)控，從而啟動(dòng)廣泛的轉(zhuǎn)錄調(diào)控級(jí)聯(lián)反應(yīng)。研究開發(fā)了基于細(xì)胞水平的TARGET系統(tǒng)，利用時(shí)間梯度系列的ChIP-seq鑒定到NLP7在極短時(shí)間內(nèi)調(diào)控的進(jìn)核過程及瞬時(shí)結(jié)合的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的靶基因。同時(shí)，通過DNA腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶(Dam)融合蛋白標(biāo)記轉(zhuǎn)錄因子接觸過的瞬時(shí)互作蛋白的啟動(dòng)子(DamID)，利用穩(wěn)定的腺嘌呤甲基化標(biāo)記捕獲和鑒定轉(zhuǎn)錄因子與靶基因間的互作，這種方法相較于ChIP具有明顯優(yōu)勢(shì)。
研究在擬南芥根細(xì)胞中鑒定到三類NLP7的全基因組范圍的靶基因，包括穩(wěn)定的、瞬時(shí)的與極瞬時(shí)的互作蛋白。研究發(fā)現(xiàn)，捕獲到的NLP7瞬時(shí)和極瞬時(shí)靶基因中，有50%受NLP7調(diào)控但并不與其結(jié)合。這些蛋白在早期氮響應(yīng)過程中富集，包括之前報(bào)道過的LBD37/LBD38、CDF1、TGA4等，但它們?cè)诘憫?yīng)過程中的位置未在NLP7下游發(fā)現(xiàn)。該研究證實(shí)這些蛋白及新發(fā)現(xiàn)的兩種轉(zhuǎn)錄因子HAP2C和NAC096，以及一個(gè)Integrase-type DNA(At4g39780)作為NLP7下游在整個(gè)根系中調(diào)控53%的氮響應(yīng)基因。
綜上所述，該研究揭示了NLP7動(dòng)態(tài)調(diào)控的早期氮響應(yīng)過程中的信號(hào)通路級(jí)聯(lián)反應(yīng)及氮信號(hào)響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的時(shí)空層級(jí)適應(yīng)，對(duì)理解植物氮素響應(yīng)機(jī)制提供了重要見解。
勵(lì)妍17536448734： 【C17】 - 上學(xué)吧
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ 長(zhǎng)期以來他所組織和領(lǐng)導(dǎo)的課題組執(zhí)著追求、刻苦科研,在他自己的科研領(lǐng)域里,取得了一些創(chuàng)新性的成果.主要表現(xiàn)在:1、發(fā)現(xiàn)新的類Batti-堿反應(yīng)及捕獲Sharpless反應(yīng)中間體:在合成手性配體的過程中,發(fā)現(xiàn)了一類新的具有普遍性的類Batti...
勵(lì)妍17536448734： 怎樣學(xué)好英語(yǔ)口語(yǔ)啊? -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ 英語(yǔ)口語(yǔ)學(xué)習(xí)方法總匯 (1).We study spoken English so as to make oral communications, so this order of importance of oral English study should be followed: Fluency, Accuracy, and Appropriateness. That is to say, we have to pay more attention ...
勵(lì)妍17536448734： 求助,有誰(shuí)做超疏水,超疏油材料的 -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ 近幾年,柱狀結(jié)構(gòu)陣列碳納米管膜的超疏水材料的研究有了很大的進(jìn)展,納米超疏水材料以其優(yōu)越的性能,超強(qiáng)的疏水能力,在家電行業(yè)中有著越來越廣泛的應(yīng)用前景. 1.固體表面浸潤(rùn)性及主要指標(biāo)浸潤(rùn)性指當(dāng)液體和固體表面接觸時(shí),液體可...
勵(lì)妍17536448734： 求經(jīng)貿(mào)類的法語(yǔ)詞匯(專業(yè)術(shù)語(yǔ)) -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ Général 差距: distance, écart, disparité 促進(jìn): promouvoir, stimuler, encourager 繁榮: florissant, prospère 流通: circuler, cours, circulation 提供: fournir, offrir, présenter 吸引: attirer, captiver 轉(zhuǎn)移: déplacer, transférer 蒸蒸日上: prospérer ...
勵(lì)妍17536448734： c?té的意思 -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ c?té:俗語(yǔ) 有關(guān)…方面 未完成過去時(shí)1、表示習(xí)慣的動(dòng)作或是某個(gè)狀態(tài) 2、用來描寫自然狀態(tài)或是情緒狀態(tài),如:時(shí)間、氣候、年齡、感受 3、在一段不明起止的時(shí)間內(nèi)的動(dòng)作或狀態(tài) 4、與過去完成時(shí)(passé composé)連用,表示其動(dòng)作發(fā)生的背景 5、表示愿望或建議 6、用于si引導(dǎo)的條件句中 . 7、用于短語(yǔ)être en train de 和 venir de 的過去時(shí)
勵(lì)妍17536448734： 找法語(yǔ)高手做個(gè)題. 把詞填進(jìn)去. recycler, trie, jette, protege, -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ Moi, je respecte la planete!jette les papaiers a la poubelle. Pour recycler les dechets,(這句話好像不完整...)J'eteins la lumiere qua...
勵(lì)妍17536448734： 世界地理歐洲聯(lián)盟現(xiàn)在總共是有多少個(gè)國(guó)家呢.....
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ 歐洲聯(lián)盟(European Union),簡(jiǎn)稱歐盟(EU),是由歐洲共同體 (European Communities,又稱歐洲共同市場(chǎng)) 發(fā)展而來的,是一個(gè)集政治實(shí)體和經(jīng)濟(jì)實(shí)體于一身、...
勵(lì)妍17536448734： 上課愛走神怎么辦? -
鹿城區(qū)轉(zhuǎn)向： ______ 屬普遍情況,要克服也容易,自己有意識(shí)經(jīng)常提醒自己,或選一個(gè)前排聽課認(rèn)真的同學(xué)做自己榜樣.如果用心克服,半年就可以了.我小學(xué)時(shí)以別人為榜樣克服了上課走神現(xiàn)象;高中自己克服,用半年做到兩...
調(diào)控蛋白與基因間的動(dòng)態(tài)互作對(duì)于生物體在時(shí)空上響應(yīng)環(huán)境刺激及細(xì)胞代謝變化至關(guān)重要。然而，轉(zhuǎn)錄因子與其全基因組范圍上的瞬時(shí)互作在當(dāng)前研究中仍不完整。研究中，通過開發(fā)基于細(xì)胞水平的TARGET系統(tǒng)及時(shí)間梯度系列的ChIP-seq和DNA腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶標(biāo)記鑒定(DamID-seq)方法，研究人員成功捕獲了NLP7在早期氮響應(yīng)過程中的全基因組范圍的靶基因之間的穩(wěn)定和瞬時(shí)互作蛋白。
NLP7在氮供應(yīng)條件下數(shù)分鐘內(nèi)磷酸化進(jìn)入細(xì)胞核，在植物體內(nèi)調(diào)控的大部分基因通常通過傳統(tǒng)ChIP方法難以檢測(cè)到。這些靶基因可能通過瞬時(shí)互作的形式或受NLP7間接調(diào)控，從而啟動(dòng)廣泛的轉(zhuǎn)錄調(diào)控級(jí)聯(lián)反應(yīng)。研究開發(fā)了基于細(xì)胞水平的TARGET系統(tǒng)，利用時(shí)間梯度系列的ChIP-seq鑒定到NLP7在極短時(shí)間內(nèi)調(diào)控的進(jìn)核過程及瞬時(shí)結(jié)合的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的靶基因。同時(shí)，通過DNA腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶(Dam)融合蛋白標(biāo)記轉(zhuǎn)錄因子接觸過的瞬時(shí)互作蛋白的啟動(dòng)子(DamID)，利用穩(wěn)定的腺嘌呤甲基化標(biāo)記捕獲和鑒定轉(zhuǎn)錄因子與靶基因間的互作，這種方法相較于ChIP具有明顯優(yōu)勢(shì)。
研究在擬南芥根細(xì)胞中鑒定到三類NLP7的全基因組范圍的靶基因，包括穩(wěn)定的、瞬時(shí)的與極瞬時(shí)的互作蛋白。研究發(fā)現(xiàn)，捕獲到的NLP7瞬時(shí)和極瞬時(shí)靶基因中，有50%受NLP7調(diào)控但并不與其結(jié)合。這些蛋白在早期氮響應(yīng)過程中富集，包括之前報(bào)道過的LBD37/LBD38、CDF1、TGA4等，但它們?cè)诘憫?yīng)過程中的位置未在NLP7下游發(fā)現(xiàn)。該研究證實(shí)這些蛋白及新發(fā)現(xiàn)的兩種轉(zhuǎn)錄因子HAP2C和NAC096，以及一個(gè)Integrase-type DNA(At4g39780)作為NLP7下游在整個(gè)根系中調(diào)控53%的氮響應(yīng)基因。
綜上所述，該研究揭示了NLP7動(dòng)態(tài)調(diào)控的早期氮響應(yīng)過程中的信號(hào)通路級(jí)聯(lián)反應(yīng)及氮信號(hào)響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的時(shí)空層級(jí)適應(yīng)，對(duì)理解植物氮素響應(yīng)機(jī)制提供了重要見解。
相關(guān)評(píng)說：
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