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    PCR是醫(yī)學(xué)上的?它代表什么?? PCR是醫(yī)學(xué)上的?它代表什么?

    聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(英文全稱:Polymerase Chain Reaction), 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
    簡稱PCR。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是體外酶促合成特異DNA片段的一種方法,由高溫變性、低溫退火(復(fù)性)及適溫延伸等幾步反應(yīng)組成一個(gè)周期,循環(huán)進(jìn)行,使目的DNA得以迅速擴(kuò)增,具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、操作簡便、省時(shí)等特點(diǎn)。它不僅可用于基因分離、克隆和核酸序列分析等基礎(chǔ)研究,還可用于疾病的診斷或任何有DNA,RNA的地方.聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,簡稱PCR)又稱無細(xì)胞分子克隆或特異性DNA序列體外引物定向酶促擴(kuò)增技術(shù)。
    編輯本段發(fā)展簡史
      人類對于核酸的研究已經(jīng)有100多年的歷史。20世紀(jì)60年代末70年代初,人們致力于研究基因的體外分離技術(shù)。但是,由于核酸的含量較少,一定程度上限制了DNA的體外操作。Khorana于1971年最早提出核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想。但是,當(dāng)時(shí)的基因序列分析方法尚未成熟,對熱具有較強(qiáng)穩(wěn)定性的DNA聚合酶還未發(fā)現(xiàn),寡核苷酸引物的合成仍處在手工、半自動(dòng)合成階段,這種想法似乎沒有任何實(shí)際意義。   1985年,美國科學(xué)家Kary Mullis在高速公路的啟發(fā)下,經(jīng)過兩年的努力,發(fā)明了PCR技術(shù),并在Science雜志上發(fā)表了關(guān)于PCR技術(shù)的第一篇學(xué)術(shù)論文。從此,PCR技術(shù)得到了生命科學(xué)界的普遍認(rèn)同,Kary Mullis也因此而獲得1993年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。   但是,最初的PCR技術(shù)相當(dāng)不成熟,在當(dāng)時(shí)是一種操作復(fù)雜、成本高昂、“中看不中用”的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)。1988年初,Keohanog通過對所使用的酶的改進(jìn),提高了擴(kuò)增的真實(shí)性。爾后,Saiki等人又在黃石公園從生活在溫泉中的水生嗜熱桿菌內(nèi)提取到一種耐熱的DNA聚合酶,使得PCR技術(shù)的擴(kuò)增效率大大提高。也正是由于此酶的發(fā)現(xiàn)使得PCR技術(shù)得到了廣泛地應(yīng)用,使該技術(shù)成為遺傳與分子生物學(xué) 分析的根本性基石。在以后的幾十年里,PCR方法被不斷改進(jìn):它從一種定性的分析方法發(fā)展到定量測定;從原先只能擴(kuò)增幾個(gè)kb的基因到目前已能擴(kuò)增長達(dá)幾十個(gè)kb的DNA片段。到目前為止,PCR技術(shù)已有十幾種之多,例如,將PCR與反轉(zhuǎn)錄酶結(jié)合,成為反轉(zhuǎn)錄PCR,將PCR與抗體等相結(jié)合就成為免疫PCR等。
    編輯本段技術(shù)原理
      DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動(dòng)子的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則復(fù)制成同樣的兩分子挎貝。在 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
    實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,并設(shè)計(jì)引物做啟動(dòng)子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。   但是,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不僅操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。發(fā)現(xiàn)耐熱DNA聚合同酶--Taq酶對于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時(shí)也大大降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。
    編輯本段工作原理
      類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火(復(fù)性)--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí) 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
    間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至40~60℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在DNA聚合酶的作用下,于72℃左右,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍。
    編輯本段反應(yīng)特點(diǎn)
      特異性強(qiáng)   PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:   ①引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;   ②堿基配對原則;   ③Taq DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實(shí)性;   ④靶基因的特異性與保守性。   其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應(yīng)的忠實(shí)性及Taq DNA聚合酶耐高溫性,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性大大增加,被擴(kuò)增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。   靈敏度高   PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級(jí)的起始待測模板擴(kuò)增到微克(μg=10-6)水平。能從100萬個(gè)細(xì)胞中檢出一個(gè)靶細(xì)胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達(dá)3個(gè)RFU(空斑形成單位);在細(xì)菌學(xué)中最小檢出率為3個(gè)細(xì)菌。   簡便、快速   PCR反應(yīng)用耐高溫的Taq DNA聚合酶,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴(kuò)增液和水浴鍋上進(jìn)行變性-退火-延伸反應(yīng),一般在2~4 小時(shí)完成擴(kuò)增反應(yīng)。擴(kuò)增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。   對標(biāo)本的純度要求低   不需要分離病毒或細(xì)菌及培養(yǎng)細(xì)胞,DNA 粗制品及RNA均可作為擴(kuò)增模板。可直接用臨床標(biāo)本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細(xì)胞、活組織等DNA擴(kuò)增檢測。
    編輯本段反應(yīng)五要素
      參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+   引物: 引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增。   設(shè)計(jì)引物應(yīng)遵循以下原則:   ①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。   ②引物擴(kuò)增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。   ③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC最好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。   ④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3'端的互補(bǔ),否則會(huì)形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。   ⑤引物3'端的堿基,特別是最末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。   ⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn), 被擴(kuò)增的靶序列最好有適宜的酶切位點(diǎn), 這對酶切分析或分子克隆很有好處。   ⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。引物量: 每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會(huì)。
    編輯本段反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
      標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系:   10×擴(kuò)增緩沖液10ul   4種dNTP混合物各200umol/L   引物各10~100pmol   模板DNA0.1~2ug   TaqDNA聚合酶2.5u   Mg2+1.5mmol/L   加雙或三蒸水至100ul   PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)
    編輯本段PCR反應(yīng)條件的選擇
      PCR反應(yīng)條件為溫度、時(shí)間和循環(huán)次數(shù)。   溫度與時(shí)間的設(shè)置: 基于PCR原理三步驟而設(shè)置變性-退火-延伸三個(gè)溫度點(diǎn)。在標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)中采用三溫度點(diǎn)法,雙鏈DNA在90~95℃變性,再迅速冷卻至40 ~60℃,引物退火并結(jié)合到靶序列上,然后快速升溫至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物鏈沿模板延伸。對于較短靶基因(長度為100~300bp時(shí))可采用二溫度點(diǎn)法, 除變性溫度外、退火與延伸溫度可合二為一,一般采用94℃變性,65℃左右退火與延伸(此溫度Taq DNA酶仍有較高的催化活性)。   ①變性溫度與時(shí)間:變性溫度低,解鏈不完全是導(dǎo)致PCR失敗的最主要原因。一般情況下,93℃~94℃min足以使模板DNA變性,若低于93℃則需延長時(shí)間,但溫度不能過高,因?yàn)楦邷丨h(huán)境對酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物完全變性,就會(huì)導(dǎo)致PCR失敗。   ②退火(復(fù)性)溫度與時(shí)間:退火溫度是影響PCR特異性的較重要因素。變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃,可使引物和模板發(fā)生結(jié)合。由于模板DNA 比引物復(fù)雜得多,引物和模板之間的碰撞結(jié)合機(jī)會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于模板互補(bǔ)鏈之間的碰撞。退火溫度與時(shí)間,取決于引物的長度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長度。對于20個(gè)核苷酸,G+C含量約50%的引物,55℃為選擇最適退火溫度的起點(diǎn)較為理想。引物的復(fù)性溫度可通過以下公式幫助選擇合適的溫度:   Tm值(解鏈溫度)=4(G+C)+2(A+T)   復(fù)性溫度=Tm值-(5~10℃)   在Tm值允許范圍內(nèi), 選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合, 提高PCR反應(yīng)的特異性。復(fù)性時(shí)間一般為30~60sec,足以使引物與模板之間完全結(jié)合。   ③延伸溫度與時(shí)間:Taq DNA聚合酶的生物學(xué)活性:   70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子   70℃ 60核苷酸/S/酶分子   55℃ 24核苷酸/S/酶分子   高于90℃時(shí), DNA合成幾乎不能進(jìn)行。   PCR反應(yīng)的延伸溫度一般選擇在70~75℃之間,常用溫度為72℃,過高的延伸溫度不利于引物和模板的結(jié)合。PCR延伸反應(yīng)的時(shí)間,可根據(jù)待擴(kuò)增片段的長度而定,一般1Kb以內(nèi)的DNA片段,延伸時(shí)間1min是足夠 的。3~4kb的靶序列需3~4min;擴(kuò)增10Kb需延伸至15min。延伸進(jìn)間過長會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增帶的出現(xiàn)。對低濃度模板的擴(kuò)增,延伸時(shí)間要稍長些。
    編輯本段酶及其濃度
      目前有兩種Taq DNA聚合酶供應(yīng), 一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,另一種為大腸菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反應(yīng)約需酶量2.5U(指總反應(yīng)體積為100ul時(shí)),濃度過高可引起非特異性擴(kuò)增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少。   dNTP的質(zhì)量與濃度 dNTP的質(zhì)量與濃度和PCR擴(kuò)增效率有密切關(guān)系,dNTP粉呈顆粒狀,如保存不當(dāng)易變性失去生物學(xué)活性。dNTP溶液呈酸性,使用時(shí)應(yīng)配成高濃度后,以1M NaOH或1M Tris。HCL的緩沖液將其PH調(diào)節(jié)到7.0~7.5,小量分裝, -20℃冰凍保存。多次凍融會(huì)使dNTP降解。在PCR反應(yīng)中,dNTP應(yīng)為50~200umol/L,尤其是注意4種dNTP的濃度要相等( 等摩爾配制),如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(shí)(偏高或偏低),就會(huì)引起錯(cuò)配。濃度過低又會(huì)降低PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量。dNTP能與Mg2+結(jié)合,使游離的Mg2+濃度降低。   模板(靶基因)核酸 模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標(biāo)本。SDS的主要功能是: 溶解細(xì)胞膜上的脂類與蛋白質(zhì),因而溶解膜蛋白而破壞細(xì)胞膜,并解離細(xì)胞中的核蛋白,SDS 還能與蛋白質(zhì)結(jié)合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白質(zhì),特別是與DNA結(jié)合的組蛋白,再用有機(jī)溶劑酚與氯仿抽提掉蛋白質(zhì)和其它細(xì)胞組份,用乙醇或異丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作為模板用于PCR反應(yīng)。一般臨床檢測標(biāo)本,可采用快速簡便的方法溶解細(xì)胞,裂解病原體,消化除去染色體的蛋白質(zhì)使靶基因游離,直接用于PCR擴(kuò)增。RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。   Mg2+濃度 Mg2+對PCR擴(kuò)增的特異性和產(chǎn)量有顯著的影響,在一般的PCR反應(yīng)中,各種dNTP濃度為200umol/L時(shí),Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜。Mg2+濃度過高,反應(yīng)特異性降低,出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,濃度過低會(huì)降低Taq DNA聚合酶的活性,使反應(yīng)產(chǎn)物減少。
    編輯本段工作步驟
       PCR反應(yīng)的基本過程
    標(biāo)準(zhǔn)的PCR過程分為三步(如圖所示):   1.DNA變性(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,   氫鍵斷裂,形成單鏈DNA   2.退火(復(fù)性)(40℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與   DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。   3.延伸(68℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右最佳的活   性)的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′ 端延   伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。   每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量既增加一倍。   現(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的時(shí)間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時(shí)在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,提高了反應(yīng)速度。
    編輯本段循環(huán)參數(shù)
      1、預(yù)變性(Initial denaturation).   模板DNA完全變性對PCR能否成功至關(guān)重要,一般95℃加熱3-5分鐘。   2、引物退火(Primer annealing)   退火溫度一般需要憑實(shí)驗(yàn)(經(jīng)驗(yàn))決定。   退火溫度對PCR的特異性有較大影響。   3、引物延伸   引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶最適溫度)。   延伸時(shí)間隨擴(kuò)增片段長短及所使用Taq酶的擴(kuò)增效率而定。   4、循環(huán)中的變性步驟   循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列完全變性:   變性時(shí)間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴(kuò)增失敗。   5、循環(huán)數(shù)   大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。   6、最后延伸   在最后一個(gè)循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸完全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。   PCR-PCR常見問題
    編輯本段電泳檢測時(shí)間
      一般為48h以內(nèi),有些最好于當(dāng)日電泳檢測,大于48h后帶型不規(guī)則甚至消失。   假陰性,不出現(xiàn)擴(kuò)增條帶   PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有①模板核酸的制備,②引物的質(zhì)量與特異性,③酶的質(zhì)量及, ④PCR循環(huán)條件。尋找原因亦應(yīng)針對上述環(huán)節(jié)進(jìn)行分析研究。   模板:①模板中含有雜蛋白質(zhì),②模板中含有Taq酶抑制劑,③模板中蛋白質(zhì)沒有消 化除凈,特別是染色體中的組蛋白,④在提取制備模板時(shí)丟失過多,或吸入酚。⑤模 板核酸變性不徹底。在酶和引物質(zhì)量好時(shí),不出現(xiàn)擴(kuò)增帶,極有可能是標(biāo)本的消化處 理,模板核酸提取過程出了毛病,因而要配制有效而穩(wěn)定的消化處理液,其程序亦應(yīng) 固定不宜隨意更改。   酶失活:需更換新酶,或新舊兩種酶同時(shí)使用,以分析是否因酶的活性喪失或不夠而 導(dǎo)致假陰性。需注意的是有時(shí)忘加Taq酶或溴乙錠。   引物:引物質(zhì)量、引物的濃度、兩條引物的濃度是否對稱,是PCR失敗或擴(kuò)增條帶不 理想、容易彌散的常見原因。有些批號(hào)的引物合成質(zhì)量有問題,兩條引物一條濃度 高,一條濃度低,造成低效率的不對稱擴(kuò)增,對策為:①選定一個(gè)好的引物合成單 位。②引物的濃度不僅要看OD值,更要注重引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,一定要有引物條帶出現(xiàn),而且兩引物帶的亮度應(yīng)大體一致,如一條引物有條帶,一條引物無條帶,此時(shí)做PCR有可能失敗,應(yīng)和引物合成單位協(xié)商解決。如一條引物亮度高,一條亮度低,在稀釋引物時(shí)要平衡其濃度。③引物應(yīng)高濃度小量分裝保存,防止多次凍融或長期放冰箱冷藏部分,導(dǎo)致引物變質(zhì)降解失效。④引物設(shè)計(jì)不合理,如引物長度不夠,引物之間形成二聚體等。   Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴(kuò)增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴(kuò)增的特 異性,濃度過低則影響PCR擴(kuò)增產(chǎn)量甚至使PCR擴(kuò)增失敗而不出擴(kuò)增條帶。   反應(yīng)體積的改變:通常進(jìn)行PCR擴(kuò)增采用的體積為20ul、30ul、50ul。或100ul,應(yīng)用多 大體積進(jìn)行PCR擴(kuò)增,是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設(shè)定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時(shí),一定要模索條件,否則容易失敗。
    編輯本段物理原因
      變性對PCR擴(kuò)增來說相當(dāng)重要,如變性溫度低,變性時(shí)間短,極有可能出現(xiàn)假陰性;退火溫度過低,可致非特異性擴(kuò)增而降低特異性擴(kuò)增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴(kuò)增效率。有時(shí)還有必要用標(biāo)準(zhǔn)的溫度計(jì),檢測一下擴(kuò)增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。   靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會(huì)成功的。假陽性出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,有時(shí)其條帶更整齊,亮度更高。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計(jì)引物。   靶序列或擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個(gè)基因組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:操作時(shí)應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或?yàn)R出離心管外。除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應(yīng)高壓消毒。所用離心管及樣進(jìn)槍頭等均應(yīng)一次性使用。必要時(shí),在加標(biāo)本前,反應(yīng)管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,與引物互補(bǔ)后,可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,而導(dǎo)致假陽性的產(chǎn)生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。   出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶   PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計(jì)的大小不一致,或大或小,或者同時(shí)出現(xiàn)特異性擴(kuò)增帶 與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、 或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù) 過多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶 則不出現(xiàn),酶量過多有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。其對策有:必要時(shí)重新設(shè)計(jì)引 物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次 數(shù)。適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。   出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶   PCR擴(kuò)增有時(shí)出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量 差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當(dāng)降低Mg2+濃 度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。
    編輯本段克隆PCR產(chǎn)物
      1)克隆PCR產(chǎn)物的最優(yōu)條件是什么?   最佳插入片段:載體比需實(shí)驗(yàn)確定。1:1(插入片段:載體)常為最佳比,摩爾數(shù)比1:8或8:1也行。應(yīng)測定比值范圍。連接用5ul 2X連接液, 50ng質(zhì)粒DNA,1Weiss單位的T4連接酶,插入片段共10ul。室溫保溫1小時(shí),或4℃過夜。在這2種溫度下,缺T-凸出端的載體會(huì)自連,產(chǎn)生藍(lán)斑。室溫保溫1小時(shí)能滿足大多數(shù)克隆要求,為提高連接效率,需4℃過夜。   2)PCR產(chǎn)物是否需要用凝膠純化?   如凝膠分析擴(kuò)增產(chǎn)物只有一條帶,不需要用凝膠純化。如可見其他雜帶,可能是積累了大量引物的二聚體。少量的引物二聚體的摩爾數(shù)也很高,這會(huì)產(chǎn)生高比例的帶有引物二聚體的克隆,而非目的插入片段。為此需在克隆前做凝膠純化。   3)如果沒有回收到目的片段,還需要作什么對照實(shí)驗(yàn)?   A)涂布未轉(zhuǎn)化的感受態(tài)細(xì)胞。   如有菌落,表明氨芐失效,或污染上帶有氨芐抗型的質(zhì)粒,或產(chǎn)生氨芐抗型的菌落。   B)轉(zhuǎn)化完整質(zhì)粒,計(jì)算菌落生長數(shù),測定轉(zhuǎn)化效率。   例如,將1ug/ul質(zhì)粒1:100稀釋,1ul用于100ul感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化。用SOC稀釋到1000ul后,用100ul鋪板。培養(yǎng)過夜,產(chǎn)生1000個(gè)菌落。轉(zhuǎn)化率為: 產(chǎn)生菌落的總數(shù)/鋪板DNA的總量。   鋪板DNA的總量是轉(zhuǎn)化反應(yīng)所用的量除以稀釋倍數(shù)。具體而言轉(zhuǎn)化用10ng DNA,用SOC稀釋到1000u后含10 ng DNA,用1/10鋪板,共用1 ng DNA。轉(zhuǎn)化率為:   1000克隆X10(3次方) ng /鋪板1 ng DNA ug=10(6次方)cfu/ ug   轉(zhuǎn)化pGEM-T應(yīng)用10(8次方)cfu/ ug感受態(tài)細(xì)胞   如沒有菌落或少有菌落,感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化率太低。   C)如用pGEM-T正對照,或PCR產(chǎn)物,產(chǎn)生>20-40藍(lán)斑(用指定步驟10(8次方)cfu/ ug感受態(tài)細(xì)胞),表明載體失去T。可能是連接酶污染了核酸酶。T4 DNA連接酶(M1801,M1804,M1794)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)好無核酸酶污染,不應(yīng)用其它來源的T4 DNA連接酶替換。   D)用pGEM-T或pGEM-T Easy載體,連接pGEM-T正對照,轉(zhuǎn)化高頻率感受態(tài)細(xì)胞(10(8次方)cfu/ug),按照指定的實(shí)驗(yàn)步驟,可得100個(gè)菌落,其中60%應(yīng)為白斑,如產(chǎn)生>20-40藍(lán)斑, 沒有菌落或少有菌落,連接有問題。   4)對照實(shí)驗(yàn)結(jié)果好,卻沒有回收到目的片段,實(shí)驗(yàn)出了什么問題?   A)連接用室溫保溫1小時(shí),能滿足大多數(shù)克隆,為提高效率,需4℃過夜。   B)插入片段帶有污染,使3`-T缺失,或抑制連接,抑制轉(zhuǎn)化。為此,將插入片段和pGEM-T正對照混合,再連接。如降低了對照的菌落數(shù),插入片段需純化,或重新制備。如產(chǎn)生大量的藍(lán)斑,插入片段污染有核酸酶,使pGEM-T或pGEM-T Easy載體3`-T缺失。   C)插入片段不適于連接。用凝膠純化的插入片段,因受UV過度照射,時(shí)有發(fā)生。UV過度照射會(huì)產(chǎn)生嘧啶二聚體,不利于連接,DNA必需重新純化。   D)帶有修復(fù)功能的耐熱DNA聚合酶的擴(kuò)增產(chǎn)物末端無A,后者是pGEM-T或pGEM-T Easy載體克隆所需。加Taq DNA聚合酶和核苷酸可在末端加A。詳情查pGEM-T pGEM-T Easy載體技術(shù)資料(TM042)。   E)高度重復(fù)序列可能會(huì)不穩(wěn)定,在擴(kuò)增中產(chǎn)生缺失和重排,如發(fā)現(xiàn)插入片段高頻率地產(chǎn)生缺失和重排,需用重組缺陷大腸桿菌菌株,如SURE細(xì)胞。
    編輯本段PCR反應(yīng)的分類
    SOEing-PCR(重疊PCR):
      重疊區(qū)擴(kuò)增基因拼接法,是基于普通PCR 技術(shù)衍生出的一種基因融合和定點(diǎn)突變的有效方法。眾所周知,由于引物只需要與模板有效結(jié)合,尤其是5’端序列不必與模板完全配對,因此擴(kuò)增引物的5’端可以添加一種甚至是兩種酶切位點(diǎn),以便于后期克隆。SOEing 法正是利用這一特點(diǎn),向兩個(gè)獨(dú)立基因摻入一段新的序列以達(dá)到兩個(gè)基因出現(xiàn)一個(gè)重疊區(qū)的目的,3’端的結(jié)合使基因融合或定點(diǎn)突變得以實(shí)現(xiàn)。
    RT-PCR(逆轉(zhuǎn)錄PCR):
      RT-PCR 為反轉(zhuǎn)錄RCR(reverse transcription PCR)和實(shí)時(shí)PCR(real time PCR)共同的縮寫。逆轉(zhuǎn)錄PCR,或者稱反轉(zhuǎn)錄PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的一種廣泛應(yīng)用的變形。在RT-PCR中,一條RNA鏈被逆轉(zhuǎn)錄成為互補(bǔ)DNA,再以此為模板通過PCR進(jìn)行DNA擴(kuò)增。

    PCR是很多學(xué)術(shù)用語的縮寫,我知道一種是生物上用來克隆基因的技術(shù)。至于醫(yī)學(xué)上的,好像是關(guān)于口腔的

    分子生物學(xué)上的;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)。

    是的,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

    cr是什么意思
    CR是計(jì)算機(jī)X射線的英文縮寫。CR是醫(yī)學(xué)影像疾病診斷的一種。CR的數(shù)字化,是通過一個(gè)可反復(fù)讀取的成像板(IP板)來替代膠片和增感屏。曝光后,IP板上生成潛影,將IP板放入CR掃描儀,用激光束對IP板進(jìn)行掃描,讀取信息,經(jīng)模\/數(shù)轉(zhuǎn)換后生成數(shù)字影像。CR優(yōu)點(diǎn):1、它在給患者進(jìn)行X線拍攝時(shí)劑量比傳統(tǒng)X線...

    CR是在醫(yī)學(xué)是什么意思
    CR是在醫(yī)學(xué)中臨床研究的重要指標(biāo)之一,CR的全稱是Clinical Response,中文意為臨床反應(yīng)。它通常用來評估新藥或新治療方法的療效,主要指患者治療后癥狀是否得到改善、生命指標(biāo)是否恢復(fù)正常、是否有效預(yù)防并發(fā)癥等方面。CR評估的標(biāo)準(zhǔn)醫(yī)學(xué)界已經(jīng)有比較標(biāo)準(zhǔn)的方法,它是評估治療效果的一種主要手段,可以幫助醫(yī)生更...

    cr在醫(yī)學(xué)上是什么意思
    cr在醫(yī)學(xué)上是指肌酸激酶的縮寫。它是一種重要的酶類物質(zhì),存在于人體肌肉組織中,特別是在心肌和骨骼肌中含量較高。肌酸激酶是人體能量代謝的關(guān)鍵酶之一,其主要功能是參與肌肉收縮和能量供應(yīng)過程。在肌肉運(yùn)動(dòng)過程中,肌酸激酶可以催化肌肉中的肌酸與磷酸反應(yīng)生成磷酸肌酸,這一反應(yīng)為肌肉提供了快速的能量...

    醫(yī)學(xué)中的CR是指什么?
    CR是醫(yī)學(xué)影像疾病診斷的一種。CR是計(jì)算機(jī)X射線(computedradiography)的英文縮寫。它使用數(shù)字化影像,方便接入PACS系統(tǒng),可結(jié)合計(jì)算機(jī)技術(shù)處理圖像,提高影像質(zhì)量。CR價(jià)格相對低廉,一套CR即可實(shí)現(xiàn)全院X線設(shè)備的數(shù)字化。

    “CR”縮寫在英語中的具體應(yīng)用和含義是什么?
    本文主要關(guān)注英語縮寫詞“CR”,它在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的含義是“環(huán)甲切除術(shù)”(cricothyroidectomy)。這個(gè)術(shù)語通常用于描述一種手術(shù),涉及切除喉部的環(huán)狀軟骨部分。中文拼音為“huán jiǎ qiē chú shù”,在英語中的流行度為159,表明它在專業(yè)術(shù)語中具有一定使用頻率。CR作為一個(gè)縮寫詞,它屬于Medical縮寫詞...

    醫(yī)學(xué)上Cr是什么意思
    醫(yī)學(xué)上,"Cr"可以指計(jì)算機(jī)X射線(Computed Radiography)或血清肌酐(Creatinine)。1. 計(jì)算機(jī)X射線(CR)是一種醫(yī)學(xué)影像診斷技術(shù)。它利用數(shù)字化影像,易于與PACS系統(tǒng)(Picture Archiving and Communication System,圖像歸檔和通信系統(tǒng))集成,通過計(jì)算機(jī)技術(shù)處理圖像,從而提升影像質(zhì)量。CR技術(shù)成本相對較低,只...

    醫(yī)學(xué)中的CR是指什么?
    CR在醫(yī)學(xué)影像學(xué)中代表計(jì)算機(jī)輔助成像技術(shù)。這一技術(shù)通過數(shù)字化X射線圖像,使影像能夠輕松集成到PACS(圖片存檔和通信系統(tǒng))中,并通過計(jì)算機(jī)算法優(yōu)化圖像質(zhì)量。CR系統(tǒng)的成本效益較高,通過單一系統(tǒng)即可實(shí)現(xiàn)全院X線成像的數(shù)字化。CR技術(shù)的主要優(yōu)勢包括:1. 在進(jìn)行X射線檢查時(shí),對患者的輻射劑量較傳統(tǒng)X射線更...

    cr是什么意思?
    2. CR在營銷領(lǐng)域的含義 在商業(yè)和市場營銷領(lǐng)域,CR常用來表示“顧客關(guān)系”。在這個(gè)語境下,CR指的是企業(yè)與其客戶之間建立的長期互動(dòng)和溝通。建立穩(wěn)固的顧客關(guān)系對于企業(yè)的成功至關(guān)重要,它能夠提高客戶滿意度、增加回購率并促進(jìn)口碑傳播。為了建立良好的顧客關(guān)系,企業(yè)通常會(huì)采取多種策略,如提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品或...

    醫(yī)學(xué)上Cr是什么意思
    1. Computer Radiography(CR)是醫(yī)學(xué)影像學(xué)中的一種技術(shù),它利用數(shù)字化影像來輔助疾病診斷。2. CR系統(tǒng)能夠方便地與Picture Archiving and Communication System(PACS)集成,通過計(jì)算機(jī)技術(shù)處理圖像,從而提升影像的診斷質(zhì)量。3. 與其他影像技術(shù)相比,CR的成本較低,一套CR系統(tǒng)就能實(shí)現(xiàn)全院X射線設(shè)備的數(shù)字...

    Cr是什么意思醫(yī)學(xué)
    4. 醫(yī)學(xué)中的其他用途 除了評估腎功能,Cr在某些醫(yī)學(xué)研究中還有其他的用途。例如,在某些類型的肌肉疾病研究中,肌酐的水平可能作為肌肉損傷或肌肉活動(dòng)度的指標(biāo)。總的來說,Cr在醫(yī)學(xué)中特指肌酐,它是評估腎臟功能的重要指標(biāo)之一。了解肌酐的正常范圍及其變化對于及時(shí)發(fā)現(xiàn)腎臟問題并采取相應(yīng)的醫(yī)療措施具有重要...

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