（一）概述：NGS測(cè)序在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用
繁衍、變異、自然選擇和生存斗爭(zhēng)，是所有生物必須經(jīng)歷的。
因?yàn)樯牡谝灰x，是生存。
為了生存，必須斗爭(zhēng)，生物之間為了爭(zhēng)奪資源，以及生物與自然環(huán)境之間，都存在著斗爭(zhēng) ，在這個(gè)過程中，有些微生物能夠與人類和平共處，甚至互利共生，而有的微生物則會(huì)使人患病，通常有細(xì)菌、真菌、病毒、支原體，以及衣原體，這些就是臨床上的病原微生物。
自然選擇需要經(jīng)歷漫長的過程，但是近年來環(huán)境污染，藥物濫用，加快了病原微生物的進(jìn)化速度，耐藥菌，超級(jí)菌的出現(xiàn)，嚴(yán)重威脅著人類健康。
還有一些微生物，本來與人類沒有交集，原先只存在于自然界，而有人為了獵奇，食用野生動(dòng)物，從而把這些動(dòng)物身上攜帶的病毒帶到了人類社會(huì)，如本世紀(jì)初的非典病毒（Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS）就是例子，這類新型病毒對(duì)公共衛(wèi)生健康形成了巨大的挑戰(zhàn)，個(gè)別人的貪婪，給全世界的人們帶來了巨大的災(zāi)難。
當(dāng)健康受到了威脅，對(duì)付細(xì)菌，人類發(fā)明了抗生素， 對(duì)付病毒，發(fā)明了抗病毒藥物，但要如何治療，第一步是找出元兇，而這在臨床上往往存在困難。
傳統(tǒng)的血常規(guī)，或者器官和組織的影像學(xué)指標(biāo)能夠判斷感染的可能性，但并不能作為確診的依據(jù)，比如血常規(guī)只能告訴你是否有細(xì)菌或病毒感染，但不能告訴你是什么細(xì)菌或病毒，還需要進(jìn)一步檢查才能確診，以便對(duì)癥下藥。
實(shí)驗(yàn)室檢查，如抗原檢測(cè)、核酸檢測(cè)、代謝產(chǎn)物檢測(cè)以及毒素檢測(cè)才是明確感染、指導(dǎo)治療和判斷預(yù)后的重要手段。
為了克服傳統(tǒng)方法的不足，下一代測(cè)序技術(shù)（Next-generation sequencing technology，NGS）在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用具有非常大的優(yōu)勢(shì)，如：
當(dāng)然，NGS的缺點(diǎn)也是有的：
即便有不足，但NGS的技術(shù)優(yōu)勢(shì)更為明顯，在疑難微生物，以及難以培養(yǎng)甚至無法分離培養(yǎng)的少見菌屬的鑒定，特別是新型病原微生物的暴發(fā)流行監(jiān)測(cè)方面，NGS快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn)，使其成為病毒鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)，在流行病學(xué)分型中發(fā)揮著重要作用。
新型冠狀病毒（Corona Virus Disease 2019, COVID-19）正肆虐全球，目前尚無疫苗和特效藥，人們除了戴口罩，注意個(gè)人衛(wèi)生以及增加社交距離外別無他法，面對(duì)洶涌的疫情，再一次提醒人類，要放下自己是萬物之靈的傲慢，因?yàn)槲⑸锊攀钱?dāng)之無愧的地球之王，它們?cè)谶@個(gè)星球上生存的歷史比人類更長，種類和數(shù)量也比人類要多得多。
我們不能，也不應(yīng)該試圖消滅所有微生物。我們之間的關(guān)系，不只有對(duì)抗，還有合作，但是當(dāng)我們的健康受到威脅時(shí)，也要勇于斗爭(zhēng)。
物競(jìng)天擇，適者生存，人類與微生物的合作與斗爭(zhēng)，必將永遠(yuǎn)進(jìn)行下去。
NGS檢測(cè)是什么意思
NGS，又稱高通量測(cè)序技術(shù)。目前經(jīng)常用于遺傳病的篩查、產(chǎn)前的檢測(cè)或診斷、腫瘤的臨床診斷、藥物基因組學(xué)檢測(cè)、癌癥的化療與治療、單基因疾病篩查或診斷等，可以通過并行原理一次性對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行檢測(cè)，如血液和尿液活檢或?qū)嶓w瘤突變基因組測(cè)序、孕婦進(jìn)行DNA血液檢查即可進(jìn)行遺傳疾病的篩查，避...
...檢測(cè)技術(shù)臨床應(yīng)用專家共識(shí)(2023)》推薦NGS檢測(cè)技術(shù)
目前該技術(shù)主要分為三類：無偏倚檢測(cè)的mNGS、檢測(cè)多重病原體及其耐藥基因或毒力基因的tNGS和獲取某一種或多種病原體全基因組數(shù)據(jù)的高通量測(cè)序技術(shù)（whole-genome sequencing，WGS）。由于病原體高通量測(cè)序技術(shù)復(fù)雜、結(jié)果解讀難度大且價(jià)格昂貴，建議根據(jù)臨床需求在傳統(tǒng)微生物檢測(cè)的基礎(chǔ)上選擇性使用，例如，...
ngs基因檢測(cè)什么意思
與傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序方法相比，ngs技術(shù)在大規(guī)模樣本處理上具有明顯優(yōu)勢(shì)，其快速性和高通量特性使其在生物科學(xué)研究和臨床應(yīng)用中占據(jù)主導(dǎo)地位。目前，主流的ngs測(cè)序平臺(tái)主要包括illumina測(cè)序技術(shù)（如Solexa技術(shù)）和454測(cè)序技術(shù)（主要以焦磷酸測(cè)序聞名，盡管讀長較長但準(zhǔn)確度相對(duì)較低，成本較高）。另外，solid測(cè)序...
ngs檢測(cè)是什么意思?
ngs檢測(cè)，就是新一代基因測(cè)序技術(shù)的縮寫，它代表了高通量測(cè)序這一前沿科學(xué)領(lǐng)域的核心手段。近年來，ngs技術(shù)在全球生命科學(xué)領(lǐng)域取得了顯著的進(jìn)步，其在疾病診斷、遺傳研究、藥物開發(fā)等多個(gè)方面的應(yīng)用日益廣泛，成為了推動(dòng)生命科學(xué)前進(jìn)的重要力量。它的出現(xiàn)，使得科學(xué)家們能夠以前所未有的速度和精度解析遺傳...
mNGS在感染性疾病診斷中的意義
mNGS無需靶向擴(kuò)增。不需預(yù)知病原基因組序列信息，因而能夠檢測(cè)包括細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲等在內(nèi)的所有病原，這就像打仗時(shí)的地毯式轟炸。地毯式轟炸浪費(fèi)的是彈藥，地毯式測(cè)序浪費(fèi)的是鈔票，一次mNGS收費(fèi)動(dòng)輒三千五千，且不入醫(yī)保。三五千塊錢，買的只是一個(gè)病原微生物名字，短的3個(gè)字，長的也不超過10...
ngs是什么意思
ngs是Ngs檢測(cè)，屬于高通量測(cè)序技術(shù)的簡稱，也被稱為下一代測(cè)序技術(shù)，近些年來檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展非常的迅猛，在生命科學(xué)領(lǐng)域的重要也是不言而喻的。高通量測(cè)序經(jīng)過近十年來的迅猛發(fā)展，已經(jīng)深入到生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域，不僅有力地推動(dòng)了基礎(chǔ)研究的發(fā)展，也在逐漸征服臨床應(yīng)用。與Sanger法為代表的傳統(tǒng)測(cè)序法相比...
病原微生物NGS生信分析案例解讀
在進(jìn)行樣本處理、核酸提取、文庫制備、上機(jī)測(cè)序等一系列操作后，我們獲得病原微生物NGS數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)的價(jià)值在于經(jīng)過生物信息學(xué)分析和準(zhǔn)確解讀。實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)需要一個(gè)完備的分析平臺(tái)和高專業(yè)素質(zhì)的研究人員。本文將通過一篇文獻(xiàn)案例來展示如何利用CLC平臺(tái)進(jìn)行微生物數(shù)據(jù)的分析。案例聚焦于高致病性ST5甲氧西林...
專家談:mNGS與tNGS
mNGS（metagenomics next generation sequencing）技術(shù)通過直接提取臨床樣本中的核酸進(jìn)行文庫構(gòu)建和高通量測(cè)序，利用生物信息學(xué)算法分析樣本中包含的病原微生物序列種類及耐藥基因，快速且準(zhǔn)確地檢測(cè)各種臨床樣本中的病原微生物。該技術(shù)檢測(cè)范圍廣泛，能夠同時(shí)檢測(cè)細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲等，尤其在罕見和新發(fā)病...
醫(yī)院的NGS檢測(cè)是什么
大幅降低遺傳疾病風(fēng)險(xiǎn)；全外顯子組測(cè)序?qū)Ｗ⒂诰幋a區(qū)域，捕捉致病突變；目標(biāo)區(qū)域測(cè)序則通過定制探針鎖定目標(biāo)基因區(qū)域進(jìn)行分析。這項(xiàng)技術(shù)通常用于凍胚移植，等待NGS檢查結(jié)果后再移植，以提供更準(zhǔn)確的診斷和更高的成功率。選擇NGS檢測(cè)，意味著患者將獲得更精準(zhǔn)的檢查和提升的試管嬰兒成功率。
NGS在腫瘤臨床基因檢測(cè)中的應(yīng)用2
目前，依托于NGS技術(shù)，基于病理組織的多分子標(biāo)志物檢測(cè)（組織活檢）和基于血液ctDNA檢測(cè)的液體活檢被廣泛研究。然而，由于兩種檢測(cè)方式本身的差異，兩種檢測(cè)方式的結(jié)果可能存在不一致的現(xiàn)象 [1-2] 。??在一項(xiàng)檢測(cè)EGFR突變Meta-analysis研究中 [3] ，液體活檢相比組織活檢，總體上靈敏度為68%...
相關(guān)評(píng)說：
泗陽縣張緊： ______ 泰國試管嬰兒技術(shù)發(fā)展到現(xiàn)在,各種各樣的專業(yè)技術(shù)名詞的出現(xiàn),讓做試管的家庭有點(diǎn)不明白.第三代技術(shù)PGS/PGD通用檢測(cè)手段有很多不明覺厲的名詞,今天心安小編就來給大家科普一下.1,熒光原位雜交技術(shù)(FISH)是最早的胚胎遺傳...
泗陽縣張緊： ______ A、營腐生生活的細(xì)菌和真菌屬于分解者,A正確;B、營寄生生活的細(xì)菌、病毒從活的動(dòng)植物體內(nèi)吸取有機(jī)物,不屬于分解者,B錯(cuò)誤; C、分解者利用現(xiàn)成的有機(jī)物,屬于異養(yǎng)型的微生物,C錯(cuò)誤; D、異養(yǎng)型的寄生微生物不屬于分解者,D錯(cuò)誤;故選:A.
泗陽縣張緊： ______ 高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(＂Next-generation＂ sequencing technology),以能一次并行對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長較短等為標(biāo)志.更多內(nèi)容可關(guān)注盛景基因.
泗陽縣張緊： ______ A、細(xì)菌和真菌等微生物的細(xì)胞內(nèi)無葉綠體,不能進(jìn)行光合作用,不能制造有機(jī)物,只能靠分解現(xiàn)成的有機(jī)物生活,營養(yǎng)方式為異養(yǎng),主要有寄生和腐生兩種,不符合題意. B、細(xì)菌細(xì)胞最大的特點(diǎn)是無成形的細(xì)胞核,有的細(xì)菌有鞭毛和莢膜,有的細(xì)菌沒有.符合題意. C、酵母菌屬于單細(xì)胞真菌,其結(jié)構(gòu)和植物細(xì)胞有很多相似之處,主要的區(qū)別是酵母菌細(xì)胞內(nèi)無葉綠體,植物細(xì)胞內(nèi)有葉綠體,不符合題意. D、病毒有的對(duì)人類有害,有的對(duì)人類有益,不符合題意. 故選:B
泗陽縣張緊： ______ 就是二代測(cè)序技術(shù),能夠快速檢測(cè)大量數(shù)據(jù)綜合分析基因信息.大規(guī)模檢測(cè)中成本會(huì)很低,不適合小批量檢測(cè).是基因檢測(cè)的發(fā)展方向
泗陽縣張緊： ______ 一: 答、微生物是自然界中的一群肉眼不能直接看見.必修借助光學(xué)顯微鏡或電子顯微鏡,放大幾百倍、幾千倍甚至幾萬倍才能觀察到的微小生物. 微生物分為:非細(xì)胞型微生物、原核細(xì)胞型微生物、真核細(xì)胞型微生物 二: 答 三: 答;內(nèi)毒...
