dap-seq富集圖
ATAC-seq應(yīng)用案例解析
利用ATAC-seq技術(shù)對再生心肌 Tg （gata4： EGFP +CMs） 及未損傷細(xì)胞 T g (myl7：nucDsRed) 進(jìn)行分析，對鑒定出的差異上、下調(diào)peak相關(guān)基因進(jìn)行GO分析發(fā)現(xiàn)：上調(diào)peak相關(guān)基因在調(diào)節(jié)生物過程中富集，如細(xì)胞遷移、調(diào)節(jié)細(xì)胞對刺激的反應(yīng)和細(xì)胞骨架組織；下調(diào)peak相關(guān)基因則在肌原纖維組裝等生物過...
ChIP-Seq分析之ChIPQC結(jié)果含義
沒有信號： 表示實驗失敗或者input樣本，基本看不到fragment length這個峰 也就是在特定的結(jié)合位點附近，沒有富集到reads 將peaks與基因組注釋結(jié)合起來，看看reads主要富集在哪些區(qū)域 我們的數(shù)據(jù)中，“Promoters500” and “All5UTRs”的富集程度最高，也符合預(yù)期（Nanog和Pou5f1作為轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)該結(jié)合...
DAP-seq(DNA親和純化測序)技術(shù)常見問題(input是什么)
植物組織樣本取樣的時期和部位是您根據(jù)自己的研究需求確定，不同組織和時期DNA的修飾不同，可能會影響蛋白和DNA的結(jié)合。10. DAP-seq跟ChIP-seq有何區(qū)別,DAP-seq的優(yōu)勢表現(xiàn)在哪里?DAP-seq和ChIP-seq的區(qū)別：AP-seq的優(yōu)勢：不需要針對每個轉(zhuǎn)錄因子制備特異性抗體，快速、高通量、節(jié)約時間成本。11. DA...
Cancer Cell | 卞修武院士團(tuán)隊提出膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中缺氧巨噬細(xì)胞的鑒定...
研究還發(fā)現(xiàn)，與 IDH 突變膠質(zhì)瘤相比，GBM-IDHwt 中缺氧-TAM 和 Chemo-TAM 的頻率更高，而Phago\/AP-TAM 的比例更低。研究團(tuán)隊使用癌癥基因組圖譜(TCGA)-GBM\/低級別膠質(zhì)瘤 RNA 測序 (RNA-seq) 數(shù)據(jù)集，研究了Mo-TAM 聚類方案的翻譯意義。結(jié)果表明，GBDIDHwt 中Hypoxia-TAM、Chemo-TAM、IFN-TAM ...
【轉(zhuǎn)錄因子】轉(zhuǎn)錄因子及其研究方法
特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA 片段。通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。通過qPCR或二代測序，篩選與目的蛋白互作的DNA信息。ChIP-PCR用于鑒定轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合到靶基因的啟動子上，而ChIP-seq用于篩選轉(zhuǎn)錄因子直接結(jié)合的靶基因，探究轉(zhuǎn)錄因子的作用元件。END ...
如何對植物基因組數(shù)據(jù)分析(snp)進(jìn)行描述性統(tǒng)計分析??
在SV相關(guān)基因的GO富集分析中,SV可能與ADP結(jié)合、腺苷基核糖核苷酸結(jié)合、核苷酸結(jié)合、端粒維持和多糖結(jié)合相關(guān)。作者通過組合同源性和從頭基因預(yù)測方法,使用RNA-seq數(shù)據(jù)對基因組和兩種單倍型進(jìn)行了注釋。在Hap1中鑒定出了31861個基因,平均基因長度為2953 bp,平均編碼序列(CDS)長度為249 bp。Hap2中有30642個基因,平均基因...
Nature Commun | 核心轉(zhuǎn)錄因子NLP7的全基因組瞬時互作啟動快速的氮級...
這些蛋白在早期氮響應(yīng)過程中富集，包括之前報道過的LBD37\/LBD38、CDF1、TGA4等，但它們在氮響應(yīng)過程中的位置未在NLP7下游發(fā)現(xiàn)。該研究證實這些蛋白及新發(fā)現(xiàn)的兩種轉(zhuǎn)錄因子HAP2C和NAC096，以及一個Integrase-type DNA(At4g39780)作為NLP7下游在整個根系中調(diào)控53%的氮響應(yīng)基因。綜上所述，該研究揭示了...
辟唐19192918260咨詢： 從環(huán)境中分離目的微生物時,為何一定要進(jìn)行富集培養(yǎng)? -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 1、增加目的菌的數(shù)量,增加篩選到目的菌的機(jī)會,減少篩選菌的工作量; 2、富集培養(yǎng)馴化目的菌的過程,使目的菌的產(chǎn)量或代謝性能不退化或得到加強(qiáng).
辟唐19192918260咨詢： 富集培養(yǎng)的原理 -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 富集培養(yǎng):一類使混合微生物群體中某特定微生物比例激增的培養(yǎng)方法.其一可用促進(jìn)某特定微生物生長繁殖的選擇性培養(yǎng)基或培養(yǎng)條件,其二可用抑制其他微生物生長繁殖的選擇性培養(yǎng)基或培養(yǎng)條件.如用于增殖好氧性自生固氮菌的Ashby無氮培養(yǎng)基,增殖土壤真菌用的Martin培養(yǎng)基等.其三可用連續(xù)培養(yǎng)法,在一定稀釋率下,使比生長速率小的細(xì)胞溢出培養(yǎng)器,而比生長速率大的細(xì)胞留在培養(yǎng)器中. 它的原理是利用不同微生物間生命活動特點的不同制定特定的環(huán)境條件使得僅適用于該條件的微生物旺盛生長.
辟唐19192918260咨詢： 如圖是某生態(tài)系統(tǒng)中的食物網(wǎng)簡圖.請據(jù)圖回答有關(guān)問題.(1)該食物網(wǎng)由 - -----條食物鏈組成.(2)寫出其 -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ (1)食物鏈反映的是生產(chǎn)者與消費者之間吃與被吃這種關(guān)系的,圖中食物鏈有:草→兔→鷹、草→鼠→鷹、草→鼠→蛇→鷹、草→食草昆蟲→青蛙→蛇→鷹,共有4條. (2)營養(yǎng)級越多,食物鏈越長,最長的一條食物鏈?zhǔn)遣荨巢堇ハx→青蛙→蛇...
辟唐19192918260咨詢： 解釋連續(xù)培養(yǎng)富集微生物的原理? -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 連續(xù)培養(yǎng)時,有兩個參數(shù)影響菌體濃度,既稀釋速率與生長速率,調(diào)節(jié)培養(yǎng)基,使目的菌的稀釋速率生長速率,就起到富集作用
辟唐19192918260咨詢： 您好 請問反萃取是怎么實現(xiàn)富集的? -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 萃取的時候,是將需要富集或者分離的物質(zhì)A(有時候還有其他的)萃取至有機(jī)物中,即萃取劑,然后用硫酸或者鹽酸等反萃劑反萃,反萃取過程,一般只有A物質(zhì),且反萃劑對A物質(zhì)溶解度高,反萃劑在不斷反萃取循環(huán)使用,是的A物質(zhì)得以富...
辟唐19192918260咨詢： 富集培養(yǎng)基是讓所有的細(xì)菌都能大量繁殖的培養(yǎng)基嗎? -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 不是的. 富集培養(yǎng)基就如同其表面的意思,的確是一種可以讓微生物大量繁殖,獲得高密度培養(yǎng)的培養(yǎng)基,但是不同的富集培養(yǎng)基其組成是不同的,相應(yīng)的所針對的菌種也是不同的,通常情況下一種富集培養(yǎng)基只能對一種或幾種特定菌種有伏擊培養(yǎng)效果,并不能實現(xiàn)對所有細(xì)菌的富集培養(yǎng).
辟唐19192918260咨詢： 用離子交換法分離和富集水樣中的陽離子和陰離子的原理 -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 主要利用陰陽離子在樹脂上的吸附與解吸附來完成的,比如陰離子樹脂用于有機(jī)酸的富集,而陽離子用于生物堿的富集.當(dāng)有機(jī)酸的陰離子與陰離子上的羥基負(fù)離子交換時被吸附,用酸水去洗脫,把有機(jī)酸陰離子置換下來,而達(dá)到富集效果.生物堿原理也一樣,其他成分先區(qū)分不同物質(zhì)的性質(zhì)來設(shè)計富集的方法
辟唐19192918260咨詢： 在化工原理吸收這一章,為什么進(jìn)行了氣體的吸收,還要進(jìn)行氣體的解吸? -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 有一個詞叫富集,不知道是不是你問的這個事兒. 就是說,在化工中,有些需要制備的化工產(chǎn)品(尤其是氣體),經(jīng)常在環(huán)境或者生成物中含量比較低,這樣是不好收集的,為了提高它的濃度,就用某種該氣體溶解度很高的氣體吸收這種氣體(可能是化學(xué)變化也可能是物理變化),然后再利用吹出,或者化學(xué)反應(yīng)等方式,將氣體解吸,以提高其濃度.這個過程叫富集. 希望你能滿意~
辟唐19192918260咨詢： 人組織樣本rna降解對測序結(jié)果會有影響嗎 -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 會有影響 一般RNA-seq的測序有兩種1. 用oligoT 結(jié)合polyA富集mRNA,這種情況對降解樣本的RNA測序會有很大影響,測序的結(jié)果會出現(xiàn)5'段的缺失.2. 去除核糖體RNA后直接測序,這樣測到的有mRNA和LncRNA,這樣的會降解樣本的影響會相對小一些,不過測序的數(shù)據(jù)量要求比較高一般要測到50M的reads.總體情況來說,降解樣本測序肯定會有影響,一般樣本實在取不到不講解的樣本,推薦用第二種會好一些.
辟唐19192918260咨詢： 食物鏈和生物放大作用在環(huán)境污染及對健康危害中的作用及意義 -
屏南縣形橡膠回復(fù)：
______ 在生態(tài)環(huán)境中,由于食物鏈的關(guān)系,一些物質(zhì)如金屬元素或有機(jī)物質(zhì)可以在不同的生物體內(nèi)經(jīng)吸收后逐級傳遞,不斷積聚和濃縮,最后形成了生物富集或生 物放...
