專家談：mNGS與tNGS
在醫(yī)療與科研領(lǐng)域，我國呼吸病學(xué)界的翹楚，深圳市呼吸疾病研究所所長陳榮昌教授在《Nature》這一全球頂級期刊上，深入剖析了二代測序技術(shù)在呼吸系統(tǒng)感染中的關(guān)鍵角色，特別是mNGS與tNGS的異同。陳教授強(qiáng)調(diào)，這兩種技術(shù)在診斷路徑上各有側(cè)重，引領(lǐng)著未來感染檢測的新趨勢。
mNGS——全方位的宏基因組二代測序</
mNGS以其全面的覆蓋能力，通過直接分析臨床樣本中的核酸，構(gòu)建并進(jìn)行高通量測序，生物信息學(xué)算法則揭示了病原微生物種類及耐藥基因的圖譜。這種技術(shù)不僅能快速準(zhǔn)確檢測細(xì)菌、真菌、病毒和寄生蟲，尤其在罕見和新發(fā)感染的識別上展現(xiàn)出顯著優(yōu)勢。然而，盡管其在中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染、呼吸道感染等多領(lǐng)域應(yīng)用廣泛，但高昂的成本限制了其在臨床的普及。陳教授指出，對于常見病原體，mNGS的全面篩查有時并不經(jīng)濟(jì)，目標(biāo)更為精確的tNGS技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。
tNGS——精準(zhǔn)聚焦的靶向測序</
與mNGS的廣度不同，tNGS采取靶向擴(kuò)增或捕獲技術(shù)，專注于一組特定病原體或基因組區(qū)域，降低了數(shù)據(jù)需求，提升了檢測速度。這意味著tNGS在成本效益上可能更具優(yōu)勢，尤其在臨床實踐中，它更傾向于高效檢測常見病原體，如血流感染中的大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌等。
臨床病原體的常見分布</
血流感染中，CHINET項目數(shù)據(jù)揭示了大腸埃希菌等細(xì)菌的高頻率；社區(qū)獲得性（CABSI）感染以大腸埃希菌和金黃色葡萄球菌為主，醫(yī)院獲得性（HABSI）則以肺炎克雷伯菌和鮑曼不動桿菌為主。而在神經(jīng)系統(tǒng)和呼吸道感染中，流感病毒和肺炎鏈球菌是最常見的病原體。
DRseq：未來可能的結(jié)合點</
DRseq技術(shù)集成了對57種細(xì)菌、21種真菌等50余種病原體的覆蓋，尤其針對RNA病毒如新冠和甲流，能提供分型信息。更重要的是，它還檢測13種耐藥基因，有助于防止抗生素濫用，為臨床決策提供關(guān)鍵信息。
陳教授認(rèn)為，mNGS和tNGS各有優(yōu)勢，mNGS在未知病原的探索上獨領(lǐng)風(fēng)騷，而tNGS在臨床常見病原的精確檢測上更具性價比。選擇何種技術(shù)，取決于患者的具體情況，精準(zhǔn)診斷與合理治療的需求將決定它們在感染檢測中的角色。
CDE指導(dǎo)原則三連發(fā),開啟“患者為中心”臨床試驗時代
金圻睿布局多重PCR-tNGS-mNGS多技術(shù)平臺，實現(xiàn)病原感染診斷的精準(zhǔn)化，同時在細(xì)菌真菌檢測方面也取得突破，具有性價比高、覆蓋更多患者、檢出率更高和檢測時間更快的優(yōu)勢。華仁科技被華東醫(yī)藥收購，雙方在核酸藥物核苷原料領(lǐng)域形成互補(bǔ)，華仁科技的多年技術(shù)積累和客戶資源將迅速補(bǔ)充華東醫(yī)藥現(xiàn)有工業(yè)微生物板塊，...
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